在群体基因组辩论中，构建一个高质地、代表性强的参考基因组面板（reference panel）是进步基因型填充精度的缺陷。牛和猪等经济动物已分歧开发门径化参考资源，有用鼓吹了数目性状位点（QTL）贯通和候选基因识别的施展。比拟之下，看周密球饲养量最大的家禽——鸡，此前尚短缺一套阴私等闲、样本足够、可支捏多场景期骗的高质地参考面板。

为填补这一空缺，辩论团队发起并构建了全球首个10万鸿沟鸡参考面板时势——100K GCRP（Global Chicken Reference Panel）。第一阶段效果于2025年4月15日，在Genomics, Proteomics & Bioinformatics杂志在线发表，题为“GCRP: Integrated Global Chicken Reference Panel from 11,951 Chicken Genomes” 。

该辩论由中国农业大学胡晓湘和王宇哲团队牵头，蚁集国表里多个单元互助完成，第一阶段效果构建了全球首个鸡类参考基因组资源库，有望为鸡种遗传变异图谱构建、东说念主工遴荐辩论和精确育种提供基础撑捏。

在此项辩论中，华大智造DNBSEQ-T7基因测序平台以及MGISP-960高通量自动化样本制备系统、MGISTP-7000分杯处理系统为时势组提供了从样本处理到基因测序的系统支捏。畜禽全基因组遴荐常常面对着样本量强大、资本条目尖刻等问题，华大智造一站式管制平台的业务模式适值大略管制这一迂曲，华大智造超高通量基因测序仪匹配自动化产线，一方面大略在样本处理和建库通量上完了高通量、高效用、低资本，另一方面也大大镌汰了时间资本，进一步匹配畜禽育种的产业需求。

据了解，鸡的驯化历史可追念至约8000年前，发祥于散播在南亚和东南亚的原鸡（Gallus gallus）。原鸡不仅是首个完周密基因组测序的鸟类，亦然最早被解码的脊椎动物基因组之一。现在，环球变异数据库（如 dbSNP v106）已收录约2343万个单核苷酸多态性位点（SNP）和240万个短插入/缺失变异（InDel），为鸡的基因组琢磨分析（GWAS）和功能基因挖掘提供了进犯基础。

跟着低深度测序（LCS）本领的发展，辩论者得以在收尾资本的同期完了大鸿沟样本测序，弥补传统SNP芯片信息阴私不及的局限，为基因组遴荐与雅致化变异定位提供了新可能。

第一阶段效果接管低深度测序取得了 10104 份商品鸡样本，此外征集了1847个高尚度测序样本，构建了两个高质地子面板（CBP 与 CMP），系统评估了不同战略下的基因型填充性能，并在模拟与真正性状中展示了其在 GWAS 和因果变异定位中的上风。该资源库有望为鸡种遗传变异图谱构建、东说念主工遴荐辩论和精确育种提供基础撑捏。

中国农业大学胡晓湘评释示意，滥觞期骗低深度重测序本领时接管了入口测序平台，但历程测序实测数据的对比，华大智造测序仪的数据准确性和数据质地与入口仪器格外，况且华大智造测序仪的Duplication rate（叠加序列率）昭着低于入口平台，这将有助于得到更多的有用数据用于后续分析。

不仅如斯，华大智造测序平台以更低资本大略开释更多测序后劲，资本与效用的“双冲破”成为其在2018年切换为华大智造测序平台的进犯初志。大法子遗传系统照旧变成了期骗低深度重测序本领年处理100万样本的鸿沟。华大智造不仅提供测序仪器开yun体育网，还提供一系列自动化征战配套，完了从提真金不怕火建库到测序的全产业链闭环的生态系统。改日，还将依托于华大智造测序平台将这一本领推行到主要的猪鸡等经济动物家禽的育种企业。